Kastamonu’da doğdu. İlkokulu, hafızlığını ve orta öğrenimini Kastamonu’da tamamladı. Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi'nde 2000 yılında lisansını, 2003 yılında yüksek lisansını, 2008 yılında doktorasını tamamladı. 2012 yılında Doçent, 2018 yılında Profesör oldu. Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Felsefe ve Din Bilimleri Bölümünde Din Sosyolojisi Ana Bilim Dalında öğretim üyesi ve 5 Ekim 2020 tarihinden itibaren Din İşleri Yüksek Kurulu Üyesidir. Çapcıoğlu’nun yayımlanmış çok sayıda kitabı, uluslararası hakemli dergilerde yayımlanan makaleleri, ulusal/uluslararası kitaplarda bölümleri ve bildirileri bulunmaktadır. Avrupa Birliği, TÜBİTAK, TÜBA, YÖK, TİKA ve MEB bünyesinde yürütülen çok sayıda projede görev alan Çapcıoğlu, evli ve iki çocuk babası olup Arapça ve İngilizce bilmektedir.